RSAU-MTAA
Electronic Library

     

Details

Title: ВЫЯВЛЕНИЕ ВОзБУДИТЕЛЯ БАКТЕРИАЛьНОГО ОЖОГА СОИ PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. GLYCINEA В СЕМЕНАХ МЕТОДОМ ПЦР = DETECTION OF THE SOYBEAN BACTERIAL BLIGHT PATHOGEN PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. GLYCINEA IN SEEDS BY THE PCR // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии / Izvestiya of Timiryazev Agricultural Academy: Научно-теоретический журнал Российского государственного аграрного университета - МСХА имени К.А. Тимирязева. – 2024. – Вып. 1
Creators: ТАРАКАНОВ Р.И.; ИГНАТЬЕВА И.М.; БЕЛОШАПКИНА О.О.; ЧЕБАНЕНКО С.И.; КАРАТАЕВА О.Г.; ДЖАЛИЛОВ Ф.С.
Imprint: Москва: РГАУ-МСХА имени К.А.Тимирязева, 2024
Collection: Журнал «Известия ТСХА»
Subjects: ЗЕМЛЕДЕЛИЕ — РАСТЕНИЕВОДСТВО — ЗАЩИТА РАСТЕНИЙ; соя; бактериальный ожог сои; Pseudomonas savastanoi pv. glycinea; фитоэкспертиза семян; ПЦР; soybean; soybean bacterial blight; phytosanitary seed diagnostics; PCR
UDC: 632.3
Document type: Article, report
File type: PDF
Language: Russian
DOI: 10.26897/0021-342X-2024-1-41-52
Rights: Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Additionally: New arrival; All documents
Record key: RU/ЦНБ имени Н.И. Железнова/EPERIODIKA/EPERIODIKA-20240327-34382

Allowed Actions: Read Download (3.2 Mb)

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

В статье описано применение метода классической ПЦР для диагностики возбудителя бактериального ожога сои Pseudomonas savastanoi pv. glycinea в семенах. Изучены 2 метода выделения патогена из инфицированных семян сои, 5 методов выделения ДНК и 2 мастер-микса для приготовления реакционной смеси. Использование тестсистемы на основе ПЦР с олигонуклеотидами, специфичными на ген коронафакат-лигазы (cfl), позволило диагностировать возбудителя бактериального ожога сои в семенах при концентрации 2 × 103 КОЕ/мл. Аналитическая специфичность протокола составила 97,4% из 37 протестированных близкородственных и других бактерий. Показано, что выход продукта (площадь пика ампликона) был максимальным (645,0 ед.) при выделении ДНК при помощи набора Проба-ГС, использовании мастер-микса 5x MasDDTaqMIX-2025 и праймеров PsgFOR-1 и PsgREV-2 по 10 пМ на реакцию (25 мкл). //This article describes the application of the classical PCR method for the diagnosis of the soybean bacterial blight pathogen Pseudomonas savastanoi pv. glycinea in seeds. Two methods for pathogen isolation from infected soybean seeds, five methods for DNA extraction and two master mixes for preparation of reaction mixture were investigated. The use of a PCR-based test system with oligonucleotides specific for the coronaphacate ligase (cfl) gene allowed the diagnosis of the soybean bacterial blight pathogen in seeds at a concentration of 2 × 103 CFU/ml. The analytical sensitivity of the protocol was 97.4% of 37 closely related and other bacteria tested. Product yield (amplicon peak area) was shown to be highest (645.0 units) when DNA was isolated using the Proba-GS kit, the master mix 5x MasDDDTaqMIX-2025 and the primers PsgFOR-1 and PsgREV-2 were used at 10 pM per reaction (25 μL).

Document access rights

Network User group Action
RSAU-MTAA CSL Local Network All Read Print Download
-> Internet All Read Print Download

Usage statistics

stat Access count: 88
Last 30 days: 31
Detailed usage statistics