Table | Card | RUSMARC | |
Allowed Actions: Read Download (7.3 Mb) Group: Anonymous Network: Internet |
Annotation
Использование конкурентной аллель-специфичной ПЦР становится популярным методом для массового генотипирования сельскохозяйственных культур. Разработка маркеров на SNP в полиплоидных организмах требует дополнительной проверки и тестирования при разработке праймеров для дальнейшего использования. Предлагается алгоритм проверки и интерпретации работоспособности KASP-маркеров на пшенице с помощью существующих геномных сборок мягкой пшеницы. С помощью описанного алгоритма было проанализировано 6 KASP-маркеров на гены VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1, TGW6-A1, PSY-A1, Dreb-B1 и локус устойчивости к листовой ржавчине Lr14a. Наиболее перспективными KASP-маркерами по результатам биоинформатического анализа и ПЦР оказались маркеры на гены VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1. //The use of competitive allele-specific PCR is becoming a popular method for mass crop genotyping. The development of markers for SNPs in polyploid organisms requires additional validation for testing and interpreting the performance of KASP markers on wheat using existing common wheat genomic assemblies. Using the described algorithm, six KASP-markers on VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1, TGW6-A1, PSY-A1, Dreb-B1 and leaf rust resistance locus Lr14a were analyzed. The most promising KASP markers by bioinformatic analysis and PCR were the markers for VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1 genes.
Usage statistics
|
Access count: 212
Last 30 days: 19 Detailed usage statistics |