RSAU-MTAA
Electronic Library

     

Details

Title: КОНКУРЕНТНАЯ АЛЛЕЛЬ-СПЕЦИФИЧНАЯ ПЦР (KASP): ОСОБЕННОСТИ, ИНТЕРПРЕТАЦИ Я РЕЗУЛЬТАТОВ = COMPETITIVE ALLELE SPECIFIC PCR (KASP): FEATURES THE INTERPRETATION OF THE RESULTS // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии / Izvestiya of Timiryazev Agricultural Academy: Научно-теоретический журнал Российского государственного аграрного университета - МСХА имени К.А. Тимирязева. – 2022. – Вып. 6
Creators: НИКИТИНА Е.А.; АРХИПОВ А.В.; МИНЬКОВА Я.В.; ЯНОВСКИЙ А.C.; КОРОБКОВА В.А.; SAMARINA M.A.; ЧЕРНООК А.Г.; КРУПИН П.Ю.; КАРЛОВ Г.И.; ДИВАШУК М.Г.
Imprint: Москва: РГАУ-МСХА имени К.А.Тимирязева, 2022
Collection: Журнал «Известия ТСХА»
Subjects: ГЕНЕТИКА — БИОТЕХНОЛОГИЯ — СЕЛЕКЦИЯ И СЕМЕНОВОДСТВО; KASP; твердая пшеница; мягкая пшеница; выравнивание последовательностей; конкурентная аллель-специфичная ПЦР; молекулярный маркер; durum wheat; common wheat; sequence alignment; competitive allelespecific PCR; molecular marker
UDC: 633.11, 575
Document type: Article, report
File type: PDF
Language: Russian
DOI: 10.26897/0021-342X-2022-6-79-93
Rights: Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Additionally: All documents
Record key: RU/ЦНБ имени Н.И. Железнова/EPERIODIKA/EPERIODIKA-20230404-80320

Allowed Actions: Read Download (7.3 Mb)

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Использование конкурентной аллель-специфичной ПЦР становится популярным методом для массового генотипирования сельскохозяйственных культур. Разработка маркеров на SNP в полиплоидных организмах требует дополнительной проверки и тестирования при разработке праймеров для дальнейшего использования. Предлагается алгоритм проверки и интерпретации работоспособности KASP-маркеров на пшенице с помощью существующих геномных сборок мягкой пшеницы. С помощью описанного алгоритма было проанализировано 6 KASP-маркеров на гены VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1, TGW6-A1, PSY-A1, Dreb-B1 и локус устойчивости к листовой ржавчине Lr14a. Наиболее перспективными KASP-маркерами по результатам биоинформатического анализа и ПЦР оказались маркеры на гены VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1. //The use of competitive allele-specific PCR is becoming a popular method for mass crop genotyping. The development of markers for SNPs in polyploid organisms requires additional validation for testing and interpreting the performance of KASP markers on wheat using existing common wheat genomic assemblies. Using the described algorithm, six KASP-markers on VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1, TGW6-A1, PSY-A1, Dreb-B1 and leaf rust resistance locus Lr14a were analyzed. The most promising KASP markers by bioinformatic analysis and PCR were the markers for VIVIPAROUS-1, MOTHER OF FT AND TFL1 genes.

Document access rights

Network User group Action
RSAU-MTAA CSL Local Network All Read Print Download
-> Internet All Read Print Download

Usage statistics

stat Access count: 212
Last 30 days: 19
Detailed usage statistics