RSAU-MTAA
Electronic Library

     

Details

Title: Оптимизация молекулярно-генетической диагностики возбудителей фузариозов на озимой тритикале (×Triticosecale Wittm . & A. Camus) = Optimization of molecular diagnostics of fusarium pathogens in winter triticale (×Triticosecale Wittm . & A. Camus) // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии / Izvestiya of Timiryazev Agricultural Academy: Научно-теоретический журнал Российского государственного аграрного университета - МСХА имени К.А. Тимирязева. – 2024. – Вып. 2
Creators: Шварцев А.А.; Конышева М.Л.; Савинова С.А.; Алексеев Я.И.; Пыльнев В.В.
Imprint: Москва: РГАУ-МСХА имени К.А.Тимирязева, 2024
Collection: Журнал «Известия ТСХА»
Subjects: ЗЕМЛЕДЕЛИЕ — РАСТЕНИЕВОДСТВО — ЗАЩИТА РАСТЕНИЙ; селекция на устойчивость; грибные фитопатогены; Fusarium; ПЦР в реальном времени; диагностика; озимая тритикале; видовое разнообразие; зараженность; breeding for resistance; phytopathogenic fungi; real-time PCR; diagnostics; winter triticale; species diversity; infestation
UDC: 579.64:632.4:577.21:582.282:632.911.2
Document type: Article, report
File type: PDF
Language: Russian
DOI: 10.26897/0021-342X-2024-2-110-126
Rights: Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Additionally: All documents
Record key: RU/ЦНБ имени Н.И. Железнова/EPERIODIKA/EPERIODIKA-20240515-96239

Allowed Actions: Read Download (1.7 Mb)

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Грибные фитопатогены являются одними из самых распространенных и опасных возбудителей болезней растений, заражение которыми приводит к существенным потерям урожая и значительным экономическим затратам. Наибольший ущерб сельскохозяйственным культурам наносят грибы рода Fusarium, что делает изучение их распространения, видового разнообразия и методов диагностики более востребованным с каждым годом. В селекционной работе это изучение имеет особое значение. Определение видового состава данного патогена позволяет не только оценить степень заражения, но и проводить превентивную селекцию на устойчивость к фузариозу. Целью исследований являлась апробация разработанных праймеров и зондов для выявления наиболее распространенных представителей рода Fusarium – таких, как F. culmorum, F. graminearum и F. poae. В качестве материала для исследований использовали образцы чистых культур грибов, полученных из разных коллекций микроорганизмов. Изучалось 35 сортов озимой тритикале из коллекции РГАУ-МСХА имени К.А. Тимирязева. Для проведения видовой дифференциации исследуемых видов были сконструированы олигонуклеотиды на фрагмент гена Galactose oxidase (GalOx) и гомологичных ему генов из базы данных NCBI. Диагностика проводилась методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ). Были определены основные аналитические характеристики разработанных праймеров – такие, как специфичность и чувствительность. Скрининг 35 сортов озимой тритикале показал их поражение грибами рода Fusarium. Выявлено, что преобладающим видом является F. poae, который был обнаружен у 95,2% сортов. Для F. graminearum было обнаружено, что наибольшее распространение приходится на период с 2020 по 2021 гг., когда заражение образцов тритикале составило 31,4 и 91,4% соответственно. Наименьшее заражение было видом F. culmorum, который обнаружен только у 20% всех образцов. Дополнительно были обнаружены сорта озимой тритикале урожая 2022 г., которые меньше всего подвержены заражению изучаемыми видами: К‑1–19 № 14 К‑3851 ПРАГ502 (Дагестан) и К‑1–19 № 42 К3727 СНТ‑5/92 (Омская обл.). //Phytopathogenic fungi are among the most common and dangerous plant pathogens, causing significant crop losses and considerable economic costs. The greatest damage to agricultural crops is caused by fungi of the genus Fusarium, making the study of their distribution, species diversity and diagnostic methods more in demand every year. This is particularly important for breeding purposes. The determination of the species composition of this pathogen allows not only to evaluate the level of infestation, but also to perform preventive selection for resistance to Fusarium. The aim of the study was to test the developed primers and probes for the identification of the most common representatives of the genus Fusarium such as F. culmorum, F. graminearum and F. poae. Pure cultures of fungi obtained from different collections of microorganisms were used as research material. We studied 35 varieties of winter triticale from the RSAU-MTAA collection. In order to differentiate the studied species, oligonucleotides were designed for a fragment of the Galactose oxidase (GalOx) gene and its homologous genes from the NCBI database. Diagnosis was performed by real-time polymerase chain reaction (qPCR). The main analytical characteristics of the developed primers such as specificity and sensitivity were determined. Screening of 35 varieties of winter triticale showed their infestation with fungi of the genus Fusarium. It was revealed that the predominant species was F. poae, which was found in 95.2% of the varieties. For F. graminearum, the highest prevalence was found between 2020 and 2021, when the infestation of triticale samples was 31.4% and 91.4%, respectively. F. culmorum had the lowest percentage of infestation, being found in only 20% of all samples. In addition, the winter triticale varieties of the 2022 harvest K‑1–19#14 K‑3851 PRAG502 (Dagestan) and K‑1–19#42 K3727 SNT‑5/92 (Omsk region) were identified as the least susceptible to infestation by the studied species of fungi.

Document access rights

Network User group Action
RSAU-MTAA CSL Local Network All Read Print Download
-> Internet All Read Print Download

Table of Contents

  • AGROCHEMISTRY, SOIL SCIENCE AND ECOLOGY
  • АГРОХИМИЯ, ПОЧВОВЕДЕНИЕ, ЭКОЛОГИЯ
  • Оценка длительного воздействия бессменного выращивания различных сельскохозяйственных культур на микробные сообщества почвы
  • Н. Альсаед1, О.В. Селицкая1, Л.А. Поздняков2, И.А. Заверткин1, Е.А. Шубина1
  • Evaluation of the long-term effects of the permanent cropping on soil microbial communities
  • Alsayed Nour1, O.V. Selitskaya1, L.A. Pozdnyakov2, I.A. Zavertkin1, E.A. Shubina1
  • Поступление 137Cs в почву из луговых растений при аэральном загрязнении и формирование первичных градиентов концентраций этого поллютанта в почве на агрегатном уровне
  • С.П. Торшин, Г.А. Смолина, Ю.Е. Гусева
  • Intake of 137Сs from meadow plants into soil under aeral pollution and formation of primary gradients of this pollutant concentrations in soil at the aggregate level
  • S.P. Torshin, G.A. Smolina, Yu.E. Guseva
  • BOTANY, POMICULTURE
  • БОТАНИКА, ПЛОДОВОДСТВО
  • Адаптационная способность некоторых лекарственных растений ex vitro к почвенно-климатическим условиям Вологодской области
  • Л.В. Зарубина1, В.В. Суров1, Е.И. Куликова1, А.И. Чудецкий2, А.Н. Кульчицкий3, Д.М. Бородулин2
  • Adaptability of some ex vitro-adapted medicinal plants to the soil and climatic conditions of the Vologda region
  • L.V. Zarubina1, V.V. Surov1, E.I. Kulikova1, A.I. Chudetsky2, A.N. Kulchitsky3, D.M. Borodulin2
  • Особенности строения устьичного аппарата представителей рода Thymus L.
  • Е.Л. Маланкина1, Х.А.Х. Аль-Карави1,2, С.Л. Евграфова3
  • Structure features of the stomatal apparatus of representatives of the genus Thymus L.
  • E.L. Malankina1, H.A.H. Al-Qarawi1,2, S.L. Evgrafova3
  • Особенности фенологии некоторых представителей рода Rosa L. в условиях Европейского Севера
  • Н.Р. Сунгурова1, С.Р. Страздаускене1, Г.Н. Стругова1, И.Б. Кузнецова2, А.Н. Сахоненко3, М.В. Просин3
  • Features of the phenology of some representatives of the genus Rosa L. in the conditions of the European North
  • N.R. Sungurova1, S.R. Strazdauskene1, G.N. Strugova1, I.B. Kuznetsova2, A.N. Sakhonenko3, M.V. Prosin3
  • GENETICS, BIOTECHNOLOGY, SELECTION AND SEED BREEDING
  • ГЕНЕТИКА, БИОТЕХНОЛОГИЯ, СЕЛЕКЦИЯ И СЕМЕНОВОДСТВО
  • Закономерности формирования урожайности сортов и гибридов свеклы столовой в условиях Приамурья
  • В.В. Епифанцев, П.В. Тихончук, А.Н. Панасюк, А.А. Муратов
  • Regularities of yield formation of table beet varieties and hybrids in the conditions of the Amur region
  • V.V. Epifantsev, P.V. Tikhonchuk, A.N. Panasyuk, A.A. Muratov
  • Создание нового селекционного материала озимой пшеницы с использованием сортов венгерской селекции для Центрального региона РФ
  • И.Ф. Лапочкина1, И.Ю. Макарова1, Н.А. Яшина1, М.Д. Метт1,4, Н.Р. Гайнуллин1, М.А. Кузьмич1, И.В. Груздев2, Г.В. Волкова3
  • Development of new winter wheat breeding material using Hungarian varieties for the Central region of the Russian Federation
  • I.F. Lapochkina1, I.J. Makarova1, N.A. Yashina1, M.D. Mett1,4, N.R. Gainullin1, M.A. Kuzmich1, I.V. Gruzdev2, G.V. Volkova3
  • AGRONOMY, CROP PRODUCTION, PLANT PROTECTION
  • ЗЕМЛЕДЕЛИЕ, РАСТЕНИЕВОДСТВО, ЗАЩИТА РАСТЕНИЙ
  • Ежа сборная (Dactylis glomerata L.) – кормовая культура универсального использования в адаптивном лугопастбищном хозяйстве (обзор)
  • Н.Н. Лазарев, А.В. Шитикова, Е.М. Куренкова, О.В. Кухаренкова, С.А. Дикарева, А.Р. Тяжкороб
  • Orchardgrass (Dactylis glomerata L.) as an universal forage crop in adaptive grassland farming (review)
  • N.N. Lazarev, A.V. Shitikova, E.M. Kurenkova, O.V. Kukharenkova, S.A. Dikareva, A.R. Tyazhkorob
  • Оптимизация молекулярно-генетической диагностики возбудителей фузариозов на озимой тритикале (×Triticosecale Wittm. & A. Camus)
  • А.А. Шварцев1, 2, М.Л. Конышева1, С.А. Савинова1, Я.И. Алексеев1, 3, В.В. Пыльнев2
  • Optimization of molecular diagnostics of fusarium pathogens in winter triticale (×Triticosecale Wittm. & A. Camus)
  • A.A. Shvartsev1,2, M.L. Konysheva1, S.A. Savinova1, Ya.I. Alekseev1,3, V.V. Pylnev2
  • Чувствительность возбудителя сетчатой пятнистости листьев (Pyrenophora teres) к двухкомпонентным фунгицидам на основе триазолового и стробилуринового классов
  • Я.В. Яхник, Г.В. Волкова
  • Sensitivity of the causative agent of net blotch of barley (Pyrenophora teres) to a two-component fungicide based on triazole and strobilurine classes
  • Ya.V. Yakhnik, G.V. Volkova,
  • PLANT PHYSIOLOGY, MICROBIOLOGY
  • ФИЗИОЛОГИЯ РАСТЕНИЙ, МИКРОБИОЛОГИЯ
  • Влияние бактерий и салициловой кислоты на декоративность Campanula alliariifolia в Башкирском Предуралье
  • О.В. Ласточкина1, А.А. Реут2, А.Р. Биглова2, И.Н. Аллаярова2
  • Effect of bacteria and salicylic acid on the ornamentalness of Campanula alliariifolia in the Bashkir Cis-Ural region
  • O.V. Lastochkina1, A.A. Reut2, A.R. Biglova2, I.N. Allayarova2
  • Влияние осмотического стресса на прорастание семян Helianthus annuus L.: сахароза как осмотический регулятор
  • Д.Г. Фёдорова, Н.М. Назарова, А.М. Гвоздикова
  • Effect of osmotic stress on the germination of Helianthus annuus L. seeds: sucrose as an osmotic regulator
  • D.G. Fedorova, N.M. Nazarova, A.M. Gvozdikova
  • FARM PRODUCE STORAGE AND PROCESSING TECHNOILOGY
  • ТЕХНОЛОГИЯ ХРАНЕНИЯ И ПЕРЕРАБОТКИ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОЙ ПРОДУКЦИИ
  • Обогащение молочного продукта про- и пребиотиками
  • Е.В. Жукова, П.А. Кореневская, Е.Д. Савина, О.Н. Пастух
  • Fortification of dairy products with pro- and prebiotics
  • E.V. Zhukova, P.A. Korenevskaya, E.D. Savina, O.N. Pastukh
  • ECONOMY
  • ЭКОНОМИКА
  • Оценка размерности личных подсобных хозяйств на основе группировокпо земельной площади
  • А.В. Уколова, К.А. Козлов
  • Evaluation of the size of the private subsidiary farms based on groupings by area
  • A.V. Ukolova, K.A. Kozlov
  • Оценка инвестиционной привлекательности компаний АПК на основе ESG-факторов
  • Л.И. Хоружий, Н.А. Трясцин, М.К. Джикия, Н.Ю. Трясцина
  • Assessment of investment attractiveness of agricultural companies on the basis of ESG factors
  • L.I. Khoruzhy, N.A. Tryastsin, M.K. Dzhikiya, N.Yu. Tryastsina
  • 204.pdf
    • AGROCHEMISTRY, SOIL SCIENCE AND ECOLOGY
    • АГРОХИМИЯ, ПОЧВОВЕДЕНИЕ, ЭКОЛОГИЯ
    • Оценка длительного воздействия бессменного выращивания различных сельскохозяйственных культур на микробные сообщества почвы
    • Н. Альсаед1, О.В. Селицкая1, Л.А. Поздняков2, И.А. Заверткин1, Е.А. Шубина1
    • Evaluation of the long-term effects of the permanent cropping on soil microbial communities
    • Alsayed Nour1, O.V. Selitskaya1, L.A. Pozdnyakov2, I.A. Zavertkin1, E.A. Shubina1
    • Поступление 137Cs в почву из луговых растений при аэральном загрязнении и формирование первичных градиентов концентраций этого поллютанта в почве на агрегатном уровне
    • С.П. Торшин, Г.А. Смолина, Ю.Е. Гусева
    • Intake of 137Сs from meadow plants into soil under aeral pollution and formation of primary gradients of this pollutant concentrations in soil at the aggregate level
    • S.P. Torshin, G.A. Smolina, Yu.E. Guseva
    • BOTANY, POMICULTURE
    • БОТАНИКА, ПЛОДОВОДСТВО
    • Адаптационная способность некоторых лекарственных растений ex vitro к почвенно-климатическим условиям Вологодской области
    • Л.В. Зарубина1, В.В. Суров1, Е.И. Куликова1, А.И. Чудецкий2, А.Н. Кульчицкий3, Д.М. Бородулин2
    • Adaptability of some ex vitro-adapted medicinal plants to the soil and climatic conditions of the Vologda region
    • L.V. Zarubina1, V.V. Surov1, E.I. Kulikova1, A.I. Chudetsky2, A.N. Kulchitsky3, D.M. Borodulin2
    • Особенности строения устьичного аппарата представителей рода Thymus L.
    • Е.Л. Маланкина1, Х.А.Х. Аль-Карави1,2, С.Л. Евграфова3
    • Structure features of the stomatal apparatus of representatives of the genus Thymus L.
    • E.L. Malankina1, H.A.H. Al-Qarawi1,2, S.L. Evgrafova3
    • Особенности фенологии некоторых представителей рода Rosa L. в условиях Европейского Севера
    • Н.Р. Сунгурова1, С.Р. Страздаускене1, Г.Н. Стругова1, И.Б. Кузнецова2, А.Н. Сахоненко3, М.В. Просин3
    • Features of the phenology of some representatives of the genus Rosa L. in the conditions of the European North
    • N.R. Sungurova1, S.R. Strazdauskene1, G.N. Strugova1, I.B. Kuznetsova2, A.N. Sakhonenko3, M.V. Prosin3
    • GENETICS, BIOTECHNOLOGY, SELECTION AND SEED BREEDING
    • ГЕНЕТИКА, БИОТЕХНОЛОГИЯ, СЕЛЕКЦИЯ И СЕМЕНОВОДСТВО
    • Закономерности формирования урожайности сортов и гибридов свеклы столовой в условиях Приамурья
    • В.В. Епифанцев, П.В. Тихончук, А.Н. Панасюк, А.А. Муратов
    • Regularities of yield formation of table beet varieties and hybrids in the conditions of the Amur region
    • V.V. Epifantsev, P.V. Tikhonchuk, A.N. Panasyuk, A.A. Muratov
    • Создание нового селекционного материала озимой пшеницы с использованием сортов венгерской селекции для Центрального региона РФ
    • И.Ф. Лапочкина1, И.Ю. Макарова1, Н.А. Яшина1, М.Д. Метт1,4, Н.Р. Гайнуллин1, М.А. Кузьмич1, И.В. Груздев2, Г.В. Волкова3
    • Development of new winter wheat breeding material using Hungarian varieties for the Central region of the Russian Federation
    • I.F. Lapochkina1, I.J. Makarova1, N.A. Yashina1, M.D. Mett1,4, N.R. Gainullin1, M.A. Kuzmich1, I.V. Gruzdev2, G.V. Volkova3
    • AGRONOMY, CROP PRODUCTION, PLANT PROTECTION
    • ЗЕМЛЕДЕЛИЕ, РАСТЕНИЕВОДСТВО, ЗАЩИТА РАСТЕНИЙ
    • Ежа сборная (Dactylis glomerata L.) – кормовая культура универсального использования в адаптивном лугопастбищном хозяйстве (обзор)
    • Н.Н. Лазарев, А.В. Шитикова, Е.М. Куренкова, О.В. Кухаренкова, С.А. Дикарева, А.Р. Тяжкороб
    • Orchardgrass (Dactylis glomerata L.) as an universal forage crop in adaptive grassland farming (review)
    • N.N. Lazarev, A.V. Shitikova, E.M. Kurenkova, O.V. Kukharenkova, S.A. Dikareva, A.R. Tyazhkorob
    • Оптимизация молекулярно-генетической диагностики возбудителей фузариозов на озимой тритикале (×Triticosecale Wittm. & A. Camus)
    • А.А. Шварцев1, 2, М.Л. Конышева1, С.А. Савинова1, Я.И. Алексеев1, 3, В.В. Пыльнев2
    • Optimization of molecular diagnostics of fusarium pathogens in winter triticale (×Triticosecale Wittm. & A. Camus)
    • A.A. Shvartsev1,2, M.L. Konysheva1, S.A. Savinova1, Ya.I. Alekseev1,3, V.V. Pylnev2
    • Чувствительность возбудителя сетчатой пятнистости листьев (Pyrenophora teres) к двухкомпонентным фунгицидам на основе триазолового и стробилуринового классов
    • Я.В. Яхник, Г.В. Волкова
    • Sensitivity of the causative agent of net blotch of barley (Pyrenophora teres) to a two-component fungicide based on triazole and strobilurine classes
    • Ya.V. Yakhnik, G.V. Volkova,
    • PLANT PHYSIOLOGY, MICROBIOLOGY
    • ФИЗИОЛОГИЯ РАСТЕНИЙ, МИКРОБИОЛОГИЯ
    • Влияние бактерий и салициловой кислоты на декоративность Campanula alliariifolia в Башкирском Предуралье
    • О.В. Ласточкина1, А.А. Реут2, А.Р. Биглова2, И.Н. Аллаярова2
    • Effect of bacteria and salicylic acid on the ornamentalness of Campanula alliariifolia in the Bashkir Cis-Ural region
    • O.V. Lastochkina1, A.A. Reut2, A.R. Biglova2, I.N. Allayarova2
    • Влияние осмотического стресса на прорастание семян Helianthus annuus L.: сахароза как осмотический регулятор
    • Д.Г. Фёдорова, Н.М. Назарова, А.М. Гвоздикова
    • Effect of osmotic stress on the germination of Helianthus annuus L. seeds: sucrose as an osmotic regulator
    • D.G. Fedorova, N.M. Nazarova, A.M. Gvozdikova
    • FARM PRODUCE STORAGE AND PROCESSING TECHNOILOGY
    • ТЕХНОЛОГИЯ ХРАНЕНИЯ И ПЕРЕРАБОТКИ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОЙ ПРОДУКЦИИ
    • Обогащение молочного продукта про- и пребиотиками
    • Е.В. Жукова, П.А. Кореневская, Е.Д. Савина, О.Н. Пастух
    • Fortification of dairy products with pro- and prebiotics
    • E.V. Zhukova, P.A. Korenevskaya, E.D. Savina, O.N. Pastukh
    • ECONOMY
    • ЭКОНОМИКА
    • Оценка размерности личных подсобных хозяйств на основе группировокпо земельной площади
    • А.В. Уколова, К.А. Козлов
    • Evaluation of the size of the private subsidiary farms based on groupings by area
    • A.V. Ukolova, K.A. Kozlov
    • Оценка инвестиционной привлекательности компаний АПК на основе ESG-факторов
    • Л.И. Хоружий, Н.А. Трясцин, М.К. Джикия, Н.Ю. Трясцина
    • Assessment of investment attractiveness of agricultural companies on the basis of ESG factors
    • L.I. Khoruzhy, N.A. Tryastsin, M.K. Dzhikiya, N.Yu. Tryastsina

Usage statistics

stat Access count: 50
Last 30 days: 21
Detailed usage statistics