Проведено гистологическое исследование состояния клеток печени и почек байкальского омуля при воздействии негативных факторов окружающей среды. Выявлено наличие морфологических аномалий в структуре клеток изучаемых органов. Микроструктурные изменения клеток печени и почек рыб позволят рекомендовать их для оценки качества неблагоприятного воздействия паразитарных инвазий и экологического состояния среды обитания гидробионтов.