RSAU-MTAA
Electronic Library

     
?

Details
Table Card RUSMARC
Title: Результаты апробации оптимизированного метода мультилокусного сиквенс-анализа патогенных бореллий группы Borrelia burgdorferi sensu lato: защищена ..2024
Creators: Крупинская Е. С.
Scientific adviser: Халилуев М. Р.; Коренберг Э. И.
Organization: Российский государственный аграрный университет - МСХА имени К. А. Тимирязева; Институт Агробиотехнологии; Кафедра биотехнологии
Imprint: Москва, 2024
Collection: Выпускные квалификационные работы
Document type: Other
File type: PDF
Language: Russian
Speciality code (FGOS): 19.04.01
Speciality group (FGOS): 190000 - Промышленная экология и биотехнологии
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Additionally: New arrival; All documents
Record key: RU/ЦНБ имени Н.И. Железнова/EBVKR-20241112-14425

Allowed Actions: –

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Document access rights

Network User group Action
RSAU-MTAA CSL Local Network All Read Print
Internet Readers Read Print
-> Internet Anonymous

Table of Contents

  • ВВЕДЕНИЕ
  • ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1.1 Клинические проявления иксодовых клещевых боррелиозов (ИКБ)
    • 1.2 Боррелии – возбудители ИКБ
    • 1.3 Методы лабораторной диагностики ИКБ
      • 1.3.1 Прямая детекция возбудителя
      • 1.3.2 Серологическая диагностика
      • 1.3.3 Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
    • 1.4 Методы определения видовой принадлежности боррелий
      • 1.4.1 ДНК–ДНК гибридизация
      • 1.4.2 Мультилокусный сиквенс–анализ (МЛСА)
      • 1.4.3 Мультилокусное сиквенс–типирование (МЛСТ)
      • 1.4.4 Сравнение методов МЛСА и МЛСТ
    • 1.5 Оптимизированный МЛСА и его значение для диагностики ИКБ
  • ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
    • 2.1 Объект исследования
    • 2.2 Материал исследования
      • 2.2.1 Сбор клещей
      • 2.2.2 Культивирование изолятов
    • 2.3 Методы исследования
      • 2.3.1 Экстракция ДНК боррелий из питательной среды
      • 2.3.2 Экстракция тотальной ДНК/РНК из гомогенизата клеща
      • 2.3.3 Амплификация тотальной ДНК/РНК из гомогенизата клеща при помощи количественной ПЦР
      • 2.3.4 Амплификация фрагментов генов recA и ospA
      • 2.3.5 Амплификация фрагментов генов hbb, rrs, groEL, fla и межгенного спейсера rrfA–rrlB
      • 2.3.6 Горизонтальный электрофорез в агарозном геле и визуализация результатов ПЦР
      • 2.3.7 Очистка ПЦР–продукта
      • 2.3.8 Секвенирование продуктов амплификации
    • 2.4 Биоинформатические методы
      • 2.4.1 Обработка нуклеотидных последовательностей
      • 2.4.2 Филогенетический анализ
  • ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
    • 3.1 Оценка результатов секвенирования последовательностей генов recA и ospA
      • 3.1.1 Анализ нуклеотидных последовательностей гена recA
      • 3.1.2 Анализ нуклеотидных последовательностей гена ospA
      • 3.1.3 Анализ сцепленных нуклеотидных последовательностей генов recA и ospA
    • 3.2 Тестирование контрольной группы изолятов по полному протоколу МЛСА
    • 3.3 Апробация возможности использования оптимизированного МЛСА для работы с полевым материалом
  • ЗАКЛЮЧЕНИЕ
  • ВЫВОДЫ
  • СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Usage statistics

stat Access count: 0
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics