RSAU-MTAA
Electronic Library

     
?

Details
Table Card RUSMARC
Title: Получение и анализ сборки генома люцерны посевной (Medicago sativa L.) на основе данных Oxford Nanopore Technologies: защищена ..2026
Creators: Рыбакова Т. Ю.
Scientific adviser: Поливанова О. Б.; Пушкова Е. С.
Organization: Российский государственный аграрный университет - МСХА имени К. А. Тимирязева; Институт агробиотехнологий; Кафедра биотехнологии
Imprint: Москва, 2026
Collection: Выпускные квалификационные работы
Document type: Other
File type: PDF
Language: Russian
Speciality code (FGOS): 19.03.01
Speciality group (FGOS): 190000 - Промышленная экология и биотехнологии
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Additionally: New arrival; All documents
Record key: RU/ЦНБ имени Н.И. Железнова/EBVKR-20260805-17741

Allowed Actions: –

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Document access rights

Network User group Action
RSAU-MTAA CSL Local Network All Read Print
Internet Readers Read Print
-> Internet Anonymous

Table of Contents

  • Введение
  • Глава 1 Обзор литературы
    • 1.1 Люцерна желтая (Medicago sativa subsp. falcata): биологические особенности, морфология, цикл развития и центры происхождения
    • 1.2 Хозяйственное значение: основная кормовая культура, роль в севообороте (азотфиксация), перспективы использования.
    • 1.3 Генетические особенности, обуславливающие сложность секвенирования и сборки.
    • 1.4 Обзор существующих сборок люцерны
    • 1.5 Клональное микроразмножение люцерны
    • 1.5.1 Введение эксплантов в культуру: стерилизация
    • 1.5.2 Прямой органогенез и микроразмножение
    • 1.5.3 Каллусогенез и органогенез
    • 1.6 Современные технологии секвенирования
    • 1.6.1 Секвенирование коротких чтений
    • 1.6.2 Секвенирование длинных чтений
    • 1.6.3 Контактные данные Hi-C
    • 1.7 Современные алгоритмы сборки геномов
  • Глава 2. Материалы и методы
    • 2.1 Растительный материал
    • 2.2 Клональное микроразмножение
    • 2.2.1 Стерилизация эксплантов
    • 2.2.2 Питательная среда и условия культивирования
    • 2.3 Выделение ядер и высокомолекулярной геномной ДНК
    • 2.3.2 Лизис ядер и очистка ДНК
    • 2.4 Контроль качества выделенной ДНК
    • 2.5 Подготовка библиотек и секвенирование
    • 2.5.1 Подготовка библиотек
    • 2.5.2 Секвенирование на платформе Oxford Nanopore Technologies (ONT)
    • 2.5.3 Секвенирование на платформе GeneMind
    • 2.5.4 Получение и контроль качества Hi-C данных
    • 2.6 Сборка и анализ генома
    • 2.6.1 Сборка генома
    • 2.6.2 Оценка качества сборки
  • Глава 3 Результаты и обсуждение
    • 3.1 Введение в культуру in vitro
    • 3.2 Оценка эффективности различных стерилизующих агентов
    • 3.3 Получение чистой высокомолекулярной ДНК
    • 3.4 Получение данных секвенирования генома
    • 3.4.1 Фильтрация прочтений и выбор оптимального набора данных
    • 3.4.2 Оценка качества сборок
    • 3.4.3 Сравнение с опубликованными геномами люцерны
    • 3.4.4 Проверка структурной корректности сборки
    • 3.5 Анализ теломерных повторов
  • Глава 4 Охрана труда
    • 4.1 Общие требования к охране труда
    • 4.2 Требования охраны труда перед началом работы
    • 4.3 Требования охраны труда во время работы
    • 4.4 Требования охраны труда в случае чрезвычайных происшествий
    • 4.5 Требования охраны труда по окончании работы
  • Выводы
  • Библиографический список

Usage statistics

stat Access count: 0
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics